El método Kjeldahl no mide, o lo hace parcialmente, ciertos compuestos de nitrógeno como las azidas, los azocompuestos, las hidrazonas, la hidracina y la hidroxilamina, los nitritos y los nitratos.
El nitrógeno total, por su parte, es la suma del nitrógeno nítrico (NO3-N), el nitrógeno nitrito (NO2-N), el nitrógeno amoniacal (NH3-N) y las estructuras de nitrógeno orgánico ligado: se determina en aquellas muestras en las que la presencia de nitrógeno inorgánico es significativa.
Conocer la composición y los compuestos del nitrógeno es esencial para las plantas de tratamiento de agua y de aguas residuales, donde el nitrógeno orgánico se convierte en nitrógeno inorgánico. Para determinar el nitrógeno total en el suelo y los lodos de las plantas de tratamiento de aguas residuales agrícolas, es necesario sumar los valores de amoníaco, nitrito, nitrato, urea y nitrógeno orgánico.
En estos casos, el método de combustión de Dumas es una alternativa válida al análisis Kjeldahl, ya que ofrece resultados más precisos y normalmente ligeramente superiores.